Kódování Base64 je stále populární, i když hlavní důvod, totiž přenos osmibitových dat sedmibitovými přenosovými linkami, pominul. Populární formát je base64 pro datová URI. Modul pro konverzi dat do a z Base64 je tedy nyní k dispozici i v YUI.

Drobná nevýhoda Base64 se objeví ve chvíli, kdy chceme nějaký Base64-encoded obsah vložit do URL. Výstup z Base64 totiž obsahuje i znaky, které mají v URL speciální význam (a je tedy nutno je kódovat) – znaky plus(+), lomeno (/) a rovnítko(=). Kódování Y64 je Base64, kde jsou tyto znaky nahrazeny pomocí tečky(.), podtržítka(_) a spojovníku(-), které lze bez problémů v URL použít.